Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtskP55097 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtskP55097 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtskP55097 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtskP55097 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms