Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CnbpP53996 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms