Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PctpP53808 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PctpP53808 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PctpP53808 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PctpP53808 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PctpP53808 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PctpP53808 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms