Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc4P51655 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc4P51655 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms