Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn1swP51491 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn1swP51491 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms