Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RorcP51450 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RorcP51450 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RorcP51450 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RorcP51450 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms