Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl5P50228 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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