Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxc13P50207 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms