Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms