Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TgfaP48030 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms