Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syt1P46096 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syt1P46096 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms