Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms