Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LtbP41155 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LtbP41155 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LtbP41155 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LtbP41155 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LtbP41155 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LtbP41155 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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