Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl28P41105 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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