Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdh4P39038 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms