Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk2P38575 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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