Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sftpa1P35242 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms