Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp4P35123 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp4P35123 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms