Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa2P31245 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms