Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tacr1P30548 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms