Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atxn10P28658 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn10P28658 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn10P28658 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atxn10P28658 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms