Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjc1P28229 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms