Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BrafP28028 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BrafP28028 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BrafP28028 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms