Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChgaP26339 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChgaP26339 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms