Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccnd1P25322 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccnd1P25322 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms