Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx3P23198 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms