Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gna11P21278 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gna11P21278 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms