Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc2P20801 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms