Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prim1P20664 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prim1P20664 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prim1P20664 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prim1P20664 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prim1P20664 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prim1P20664 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms