Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcer1aP20489 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcer1aP20489 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms