Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P20040 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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P20040 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P20040 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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P20040 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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P20040 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P20040 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P20040 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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