Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox4i1P19783 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox4i1P19783 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms