Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hoxb1P17919 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb1P17919 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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