Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa-rs1P17533 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa-rs1P17533 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms