Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgfb3P17125 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms