Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SptbP15508 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SptbP15508 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SptbP15508 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SptbP15508 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SptbP15508 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SptbP15508 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms