Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prph2P15499 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prph2P15499 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms