Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms