Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctla2aP12399 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctla2aP12399 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms