Protein–RNA interactions for Protein: P11942

Cd3g, T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3gP11942 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd3gP11942 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd3gP11942 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms