Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col4a2P08122 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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