Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TtrP07309 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TtrP07309 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TtrP07309 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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TtrP07309 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TtrP07309 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TtrP07309 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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