Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06321 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06321 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06321 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06321 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06321 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06321 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06321 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06321 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06321 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P06321 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms