Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01852 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01852 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01852 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01852 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01852 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01852 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01852 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01852 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01852 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01852 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms