Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01809 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01809 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01809 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01809 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01809 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01809 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01809 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01809 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01809 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01809 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms