Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01636 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01636 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01636 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01636 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01636 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01636 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms