Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3bO88509 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3bO88509 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms