Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfrO88507 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms