Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AurkbO70126 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AurkbO70126 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms