Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd70O55237 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd70O55237 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms